河北农业大学学报

2020, v.43;No.214(06) 101-107

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鸡内源性白血病毒ev21与其侧翼区SNP位点的连锁关系
The linkage between chicken endogenous leukemia virus ev21 and the SNP locus in the cell flanking region

葛琳涵;白少川;李雪梅;赵丽杰;乔宁;李兰会;

摘要(Abstract):

鸡内源逆转录病毒ev21的转录表达影响宿主机体健康。本试验通过PCR检测海兰褐、太行鸡、海兰灰和SPF鸡292份DNA样品的ev21阴阳性、羽型和性别,测序筛选ev21插入位点OS和US区的SNP位点,MboII酶切检测C>T突变的群体多样性,分析C>T突变与ev21整合的连锁关系;最后利用TRANSFAC?Professional预测C>T突变引起的转录因子变化。测序峰图发现,ev21插入位点上游278 bp处的C>T突变。OS和US共有610 bp酶切结果发现,快羽ev21阴性鸡为CC基因型,快羽ev21阳性鸡为CT基因型;慢羽除海兰灰和海兰褐祖代ev21阳性鸡为TT基因型外,其他均为CT基因型。OS特异1 036 bp酶切显示ev21整合的OS区全部为T单倍型,C>T突变造成转录因子结合变化。研究表明ev21整合的OS区和未整合的US区的C>T突变有5种单倍型,ev21整合与T等位基因连锁。

关键词(KeyWords): 鸡;内源性白血病病毒ev21;SNP;连锁;转录因子

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 河北省现代农业产业技术体系蛋肉鸡产业创新团队资金项目(HBCT2018150201);; 河北省重点研发计划项目(19226320D、20326350D);; 河北农业大学科研发展基金计划项目(JY2018037)

作者(Author): 葛琳涵;白少川;李雪梅;赵丽杰;乔宁;李兰会;

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DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2020.0119

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