河北农业大学学报

2019, v.42;No.206(04) 16-20+34

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玉米大斑病菌转录因子StMSN4基因的克隆及表达模式分析
Cloning and expression pattern analysis of transcription factor gene StMSN4 in Setosphaeria turcica

李学然;毕欢欢;薛江芝;李路阳;王欣宇;刘玉卫;谷守芹;韩建民;

摘要(Abstract):

为明确玉米大斑病菌转录因子StMSN4基因的结构特征及其在病菌重要生长发育时期的表达模式,本试验以酿酒酵母ScMSN4氨基酸序列为探针,在玉米大斑病菌基因组数据库中搜索并克隆其同源基因,并对该基因的结构及其编码蛋白的理化性质、空间结构等进行预测;通过分析病菌关键生长发育阶段的RNA-Seq数据,明确该基因的表达模式。结果发现,在玉米大斑病菌基因组中搜索并克隆得到了ScMSN4的同源基因,将其命名为StMSN4;该基因DNA全长为1357 bp,cDNA全长为1296 bp,包含2个外显子,1个内含子;其编码蛋白包含431个氨基酸,含有2个典型ZnF-C2H2保守结构域。通过对病菌的菌丝、分生孢子、芽管、附着胞和侵入钉时等5个典型发育时期的RNA-Seq数据分析表明,StMSN4基因在5个发育时期均有表达,且表达水平较高,表明该基因在病菌的生长发育阶段发挥着重要的作用。本研究不仅明确了StMSN4基因的结构特性及其表达模式,也为深入研究该基因的功能及HOG-MAPK信号转导途径的作用机制奠定了基础。

关键词(KeyWords): 玉米大斑病菌;MSN4;基因结构;RNA-Seq

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 河北省自然科学基金(C2016204164);; 河北省引进留学人员资助项目(CN201705);; 现代农业产业技术体系专项(CARS-02)

作者(Author): 李学然;毕欢欢;薛江芝;李路阳;王欣宇;刘玉卫;谷守芹;韩建民;

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